秋季一些地方潮湿多雨，杂菌活跃且密度大，平菇菌丝极易受害，因此应加强管理，具体采取以下技术措施：
彻底灭菌采用熟料和堆积发酵料栽培，用塑料袋栽培便于检查和管理，成功率和生物转化率均很高。
选好品种秋季气温逐渐降低，不宜选用高、中温型品种，以防低气温出现畸形菇。应选用广温型或低温型品种。
加大播种量当秋天高温高湿时，杂菌活跃，菌种的播量必须比冬季大，一般掌握在20%左右，让平菇菌丝尽快长满料面，以抑制杂菌感染、滋生。
预防“烧菌”将接种好的菌袋码成“井”字形，一般码放2层—3层高，菌种不能受压。要加强通风换气，经常检查料温，以防因高温污染而引起“烧菌”。
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