冷库是百合切花生产中不可缺少的设施，鳞茎的长期贮藏、鳞茎的低温处理打破休眠都要在冷库里进行，百合切花产品的贮藏保鲜同样需要冷库。冷库的大小根据生产规模而定。根据以往经验，如果切花百合的种植面积在20亩以内，配备的冷库容量应不小于100立方米；切花百合的种植面积超过20亩以上，每增加10亩地增加库容25至30立方米为宜。
冷库应建在生产地交通方便处，便于百合产品收获后迅速冷冻及贮藏。要求上风口、周围环境无污染，没有阳光辐射和热风较少的地方，排水良好。如果采用半地下的建设方法，不仅可以节约能源，同时有利于延长保温材料的使用寿命。
冷库的隔热材料要求导热系数小、容重小、吸湿性小、耐火、抗冻、封闭，现常用聚氨酯和聚苯乙烯。采用聚苯乙烯无缝隙喷涂工艺可以有效地减少热量(制冷量)的损失，节约能源。
夏季在冷库的上方，距离屋面30厘米以上的地方覆盖高密度的遮阳网或外加一层彩钢板，保持屋顶与覆盖物之间空气畅通，起到降温遮阳的作用，可以有效地节约能源。
制冷系统是冷库的核心，是冷库恒温的保证。要选用正规厂生产的高质量产品，并配备具有专业知识员工进行操作和日常维修。
