秋季雨量充沛，温度适宜，石榴树根系生长旺盛，深翻时所伤的小根能迅速愈合产生新根，有利于吸收营养，促进来年生长。深翻的具体时间为：果实采收后至落叶前的一段时间内。
深翻时要与熟化结合。有机肥与土壤搀合均匀，有利于土壤团粒结构的形成。将有机肥深埋的做法，改良土壤的作用小，养分也不易被根系吸收利用，是不可取的。
深翻深度要适宜。一般情况下，如果土壤不存在障碍层，如土壤砾土限制层等，深翻40厘米～50厘米即可。具体深度可根据树龄、土质情况而定。幼树宜浅，大树宜深；沙壤土宜浅，黏壤土和砾土宜深；地下水位高时宜浅耕，而地下水位深时可以深翻。一般情况下树干周围深翻15厘米～20厘米，向外逐渐加深。深翻时可采用放树盘、隔行深翻、全园深翻等形式。放树盘也称深翻扩穴，是指幼龄树栽植后第二或第三年开始，在原定植穴的外缘逐年向外深翻，每年挖宽50厘米～100厘米、深40厘米～50厘米的沟，向外扩大树盘，数年内将株行间挖透为止。隔行深翻是指隔1行深翻1行，分2年或更长的时间深翻完毕。一般在株间和行间深挖沟的两侧距主干最少１米远，以不伤大根为宜，深度为40厘米～50厘米。全园深翻是指对幼龄果园将栽植穴以外的土壤一次深翻完毕。这种方法工作量大，需劳力多，但深翻以后便于平整土地，有利于果园耕作。
