荔枝病虫种类繁多，但在生产上以荔校霜疫霉病、荔枝炭疽病、荔枝蝽蟓、荔枝瘿螨、荔枝蒂蛀虫等发生为害最严重，而且大部分集中在新梢期、花期、幼果期和果实近成熟期发生，因此，荔枝主要病虫的综合防治，应建立在对荔枝树的常规管理的基础上，才能取得成效。
根据荔枝生长过程中主要病虫发生为害情况，应以农业栽培技术防治为基础，以荔枝霜疫霉病、荔枝蒂蛀虫为重点，兼顾其他病虫的保梢、保花、保果为中心的综合治理技术。
农业技术防治，这是荔枝病虫综合防治的基础，如采果后结合修剪，剪除枯枝、阴枝、病虫校，清除残枝、落叶、落果及冬季清园，改善果园生态环境，减少虫源菌源；搞好荔枝的常规管理，合理施肥，增强树势，提高植株的抗逆性；控制冬梢抽生、恶化和中断病虫为害环境，减少越冬虫源，从根本上提高抗御病虫害的能力。
生物防治，保护和利用自然界中的各种病虫天敌（包括鸟类），控制病虫发生数量，如有条件的果园，释放平腹小蜂、松毛虫赤眼蜂，防治荔枝蝽蟓、卷叶蛾、毒蛾等；释放肿腿小峰防治龟背天牛等。
根据荔枝主要病虫的发生规律进行化学防治，减少使用化学农药杀伤果园害虫天敌，避免环境污染，破坏生态平衡是进行化学防治首先要考虑的问题。因此，对为害荔枝的主要病虫，要做好预测预报，指导适时防治，合理使用农药。在荔枝病虫害的综合防治工作中，应着重抓好下列几个时期：控制冬梢抽发，有利于翌年的开花结果，又有利于消灭越冬病虫。
春梢期或花蕾期，着重抓好荔枝蝽蟓、荔枝霜疫霉病防治，兼治瘿蚊、叶瘿蚊，可在3月中下旬用90％敌百虫800倍液加20％二氯杀螨醇800倍进行喷酒，也可同时加入64％杀毒矾600倍液或90％乙磷铝400倍，防治霜疫霉病。
幼果期，重点抓好荔枝霜疫霉病、荔枝蒂蛀虫的防治，兼治荔枝蝽蟓等其他害虫。在果实发育过程，除生理落果外，幼果期被蒂蛀虫为害而引起落果的约占生理落果的20-30％，严重的可达50％，使用10％灭百可2000倍液或40.7％乐斯本1000倍。也可用25％杀虫双水剂500倍加90％敌百虫800倍液，同时也可加入58％瑞毒霉锰锌或64％杀毒矾600倍液，防治霜疫霉病。
果实发育后期，重点仍是荔枝霜疫霉病、荔枝蒂蛀虫，根据品种不同成熟期，一般年份，早熟种防治时间为4月底5月初，中熟种5月下旬到6月上旬，迟熟品种为6月中下旬，特别迟熟或迟采收的品种7月上、中旬也需要进行防治。此时适逢果实膨大着色期，可根据测报，在荔枝蒂蛀虫成虫羽化率在30％左右喷第一次药，5-7天后重复喷一次。若此期间阴雨天多，要加强对霜疫霉病、炭疽病的防治，可在瑞毒霉锰锌中加入50％甲基托布津800倍。
培养健壮秋梢，适时喷药保护秋梢，秋梢期主要为害新梢害虫如荔枝蒂蛀虫、尖细蛾、卷叶蛾、尺蛾、瘿螨、叶瘿蚊等，可在秋梢刚抽出5厘米左右时喷第一次药，10-15天后再防治一次。药剂可选用40％水胺硫磷1000倍液，或40％乙醚甲胺磷800-1000倍液防治。
荔枝果实从开花到成熟采收，一般其发育历期为70-90天，所以在药剂防治上宜选用高效、低毒、低残留的农药，严禁使用剧毒、高残留农药如甲胺磷等。菊酯类农药会诱发螨类大发生，要控制使用次数。
