一、药害
蔬菜秧苗小而嫩，耐药性差。在施用农药时，如果方法不当，易产生药害。
发生药害的主要原因有三：一是农药选择不当，二是喷药时间不当，三是施用时用量过大。
为防止幼苗产生药害，要根据不同的病虫害进行对症下药，浓度要适当，配制时搅拌均匀，喷施雾点细而匀，不能集中在局部地点喷施过长时间，以叶片上有水滴下即可。如发现喷施浓度过大，应立即喷施清水，避免发生药害。喷药时间宜在上午通风1-2小时后进行，严禁晴天闷棚时喷药。
二、肥害
肥害是由于营养土配制不当如加入过量氮肥或腐熟不充分的有机肥引起的。此外，在进行根外追肥时肥液浓度过高也会引发肥害。发生肥害后，幼苗会出现落叶、烂根等现象。
为防止肥害的发生，应合理配制营养土，施用腐熟的有机肥，氮、磷、钾肥合理搭配；根外追肥时肥液的浓度要适当。追肥应在晴天早上通风1-2小时后进行，一旦发生肥害应立即喷水，并通风去湿。
三、草害
由于苗床环境温暖湿润，床土肥沃，苗床易长杂草。要防止杂草为害，首先应严格堆制营养土，使杂草种子在堆制期间死亡。在发生杂草害时可进行人工除草。
