菜种发芽率与保存年限关系很大。菜种不同，其保存年限也不一样。
番茄籽一般可存放３－４年，最长不要超过４年，否则会降低发芽率。鉴别新旧籽方法；新籽上有很多小茸毛，而且有番茄味；旧籽外皮茸毛少或脱落，气味也小。
黄瓜籽最多存和２、３年，超过此期限其发芽率一般降低２０－３０％，即使有的能出苗，出苗后往往无真叶，不易成活。
茄籽存放时间可稍长，一般在６年以内的种子都可用。新籽外皮有光泽，但光泽会随存放期延长而变淡。
辣椒籽不能超过３年，否则发芽率会降低。据试验，新籽发芽率在８９％以上，存放两年在79.8%左右，存放三年发芽率会降低４７％左右。颜色呈金黄色为新籽，陈籽为杏黄色。
葱籽夏天种的伏葱，必须用当年春天新打的籽，若用头年籽，小葱长起来后就会结籽。
香菜籽必须存放１年后才能用，但存放时间不宜超过３年，新籽香菜气味浓厚，陈籽气味变小。
芹菜籽可存放３年，当年结籽不能用，必须存１年后才能用。
韭菜籽必须用当年新籽，若隔年则出苗率大大降低，即使出了苗也易枯萎。白菜籽可存放２年。当年收获种子可当年播种，但有效期超过２年，出苗率一般要降低20%－27%，且抗病力变低。
