花卉病害一般分为生理病害和寄生性病害两类。
生理病害主要是由于气候和土壤等条件不适宜引起的。常发生的生理病害有：夏季强光照射引起灼伤；冬季低温造成冻害；水分过多导致烂根；水分不足引起叶片焦边、萎蔫；土壤中缺乏某些营养元素，出现缺素症等等。
寄生性病害是由于真菌、细菌、病毒、线虫等侵染花卉引起的。这些生物形态各异，但大多具有寄生力和致病力，并具有较强的繁殖力，能从感病植株通过各种途径（气孔、伤口、昆虫、风、雨等）传播到健康植株上去，在适宜的环境条件下生长、发育、繁殖、传播，周而复始，逐步扩大蔓延。因此，这类病害对花卉造成的危害最大。
真菌性病害是没有叶绿素具有真核的低等生物。它以菌丝体为营养体，以孢子进行繁殖，是花卉病害中最主要的一类。真菌病害多数具有明显的病征，如霉状物、粉状物、锈状物、点状物、丝状物等，这些特征是识别真菌病害的主要依据之一。常见的真菌性病害有白粉病、炭疽病等。
细菌性病害是一类单细胞的原核生物，用分裂方式繁殖。细菌病害的特征主要是受害组织呈水渍状或病斑透光，以及在潮湿条件下从发病部位向外溢出细菌粘液，出现“溢脓”现象，这是识别细菌病害的主要依据之一。常见的细菌性病害有鸢尾细菌性软腐病等。
病毒性病害是一种极其微小的寄生物。必须用电镜才能观察到它的形态。它寄生于花卉活细胞组织内，并能随着寄主汁液流动在花卉体内运转扩散到全株，引起全株病害。病毒病常呈现花叶、黄化、畸形、环斑等症状。常见的病毒病害有水仙病毒病等。
线虫性病害属于一类低等动物。线虫体形细长，两端稍尖，体长一般为1-2毫米，象一条蛔虫。少数线虫的雌成虫呈球形或梨形。多存活于土中，寄生在花卉根部，刺激寄主局部细胞增殖，形成瘤状物。常见的线虫病害有仙客来根结线虫病等。
