一般认为高质量的穴盘苗应根系发达，高度适中，颜色纯正，适时开花，无病虫害，其实，生产者最关注的是穴盘苗的高度。若穴盘苗过高，会导致植株柔软，易受损伤，给移植、运输和储藏带来困难，还会导致开花晚、根系不发达、易感染病虫害等不良后果；若穴盘苗过矮，同样会导致根系不发达，移植困难，质量下降，还要延长穴盘育苗时间。随着移植机械的问世，对穴盘苗的高度及其一致性也有了更高的要求。
调控穴盘苗高度的方法包括应用植物生长调节剂和非化学方法。要尽量通过栽培措施和调节生长环境来调控高度，将植物生长调节剂的施用降至最低限度。
一、非化学生长控制多年来人们采用温度、湿度、养分和光照等非化学措施调控植物生长，现在这些措施也用到了穴盘育苗中，而且直接决定了植物生长调节剂的施用量和穴盘苗的最终质量。
如果要加速穴盘苗的生长，就要提高温度，增加水分或相对湿度，多用氨态氮肥料，增加施肥量，降低光照强度。相反，如果想限制穴盘苗的生长，就要降低温度、湿度，用硝酸钙或硝酸钾代替氨态氮肥料，降低施肥量，增加光照强度或施用植物生长调节剂。应在穴盘苗最适合生长的环境条件下使用植物生长调节剂。
1．温度温度越低，植物生长就越慢，当温度降低到某一值时，植物会停止生长。花芽分化以前或花芽分化后较长一段时间，采用低温处理会导致生长迟缓，开花延迟。但非洲凤仙、长春花没有这一生理反应。如果在矮牵牛花芽分化前温度过低，即使分枝再多，开花时间也会大大延迟。
在10℃至30℃之间，植物根茎的生长随温度呈线性增加，也就是说，增加日平均温度可加速植物的生长，但必须在这一温度范围内，否则植物会完全停止生长。
调节昼夜温差会影响植物的高度和生长发育。控制昼夜温度相同牗零昼夜温差牘或白天温度低于夜间温度（负昼夜温差），可以缩短节间长度，控制株高。保持白天温度高于夜间温度，即温室正常情况，可以使节间伸长。
清晨最初两三个小时的光照是有效采用温差调控最为关键的时间。对高度控制而言，保持这段时间低温处理效果等同于保持全天低温的处理效果。必须保证日出前温度降至最低，但由于供热系统不同，调整到最低温度所需时间也不同。采用水暖的温室，温度下降得慢，应在日出前45至50分钟开始降温；而热风供暖温室，在日出前15分钟降温即可。
并不是所有的草花对昼夜温差都有同样的反应，光周期会影响它的有效性。日照时间越短，温差调节作用愈明显。
多数花卉种子发芽、真叶形成后，可以开始采用温差调节措施。为了不延误穴盘苗的整体生长，需要计算日平均温度。很多人往往频繁使用昼夜温差调节而忘记了日平均温度，致使花了较长时间穴盘苗才达到预期大小。如果在清晨两三个小时使用昼夜温差调节方法，那么，对日平均温度影响会很小。全天使用零或负昼夜温差，日平均温度会改变。
负昼夜温差常使幼叶失绿，特别是一串红和非洲菊，这种缺绿症不是营养缺乏所致，当处在正昼夜温差环境中，缺绿症会消失。应尽量避免负昼夜温差超过8℃至11℃，零昼夜温差是最好的。对昼夜温差反应敏感的品种有亚洲百合、羽状鸡冠、秋菊、石竹、非洲凤仙、天竺葵、东方百合、矮牵牛、一品红、月季、一串红、金鱼草、非洲菊牷反应不敏感或无反应的有翠菊、孔雀草、风信子、水仙花、桔梗、郁金香。
2．水分水分供应少，植物生长慢，株形紧凑，叶厚茎粗，但水分不足也可能引起钝化和开花延误。关键是掌握什么时候浇水和浇多少水。某些草花，如羽状鸡冠和孔雀草，可能会因湿度低而过早开花。提前开花的种苗，影响种苗移植后的充分生长。另一方面，水分胁迫可使非洲凤仙生长紧凑，促使坐蕾和多产生分枝，使穴盘苗易于移植，移植后成苗速度加快。
温室中的相对湿度会影响草花的高度。相对湿度大，使穴盘苗徒长。应在日落前短时期内提高温度和加强通风，使夜间相对湿度降低。第三阶段的穴盘苗不能像在第一二阶段那样喷雾灌溉。
3．营养育苗基质肥料含量高，促进幼苗快速生长，在高肥水平下种苗会徒长，使高度控制更加困难。因此，使用基质前要测试基质可溶盐含量。
对于徒长的作物，要降低肥料施用量，特别是在多云的天气。铵态氮肥（包括尿素）使穴盘苗生长柔弱，而硝酸钾和硝酸钙类的硝态氮化肥则使作物生长健壮。在冬季或多云时期，如需控制穴盘苗高度就施用含氨态氮低的肥料。光照强度低，伴随高湿度，将造成种苗柔软和徒长。
对花卉穴盘苗而言，磷也是必需元素之一。中度磷缺乏使植物生长矮小，当缺磷持续下去，症状会变得更严重，以致移植后不能正常发育。在施肥中磷的比例是氮、钾和钙的五分之一到十分之一。
4．光照北方地区冬季短日照，温室光照强度为1614lux，不能满足高质量穴盘苗的需要，因此要补光（4842至6456lux）并使光照时间达到16至18小时，促使生长低矮，促发新枝，让叶片发育好。
玻璃温室透光效果好，栽培植物要比双层塑料温室内长得矮。高光照强度（26900lux）也会使植物长得矮些。光照强度太高，温度超过32℃，基本光合作用就停止了。因此，应注意光照强度不要太高，否则，叶子可能会脱色或烧焦，特别是海棠，当光照强度增加时，施肥量也需要随之提高。
强光照也可引起对植物胁迫，加快开花，对于羽状鸡冠和孔雀草，强光照可造成成熟前开花。
5．机械方法各种方式的机械干扰在控制植物生长高度方面有积极作用，常采用的方法有接触刺激、摇动和增加空气流动。弯曲植物，尽管时间短暂，可刺激植物体内乙烯的产生，促进侧枝生长，限制顶端生长。
每天对穴盘苗进行接触刺激，可以明显矮化植株。注意不要擦坏叶子而使穴盘苗质量降低。但这一方法对三色堇和紫罗兰并没有明显作用。接触刺激不仅利于控制高度，还有益于对蚜虫和蓟马等害虫的防治。用风扇增加温室内空气流动，或把穴盘苗移到室外，也利于植株矮化。
