为保证牡丹移栽的成活率及以后的开花率，我国移栽牡丹历来多在秋季进行。北京地坛公园曾于2006年春从山东菏泽地区移栽了3至5年生牡丹3000株至北京，移栽成活率以及成活植株着花率都在95%以上，取得了技术上的突破。
移植前的准备
由于牡丹为春季进行花芽分化的植物，此时对牡丹进行分株或是移栽，使其肉质根系受损，养分难以吸收供给，植株体内正常的养分平衡遭到破坏，从而影响其花芽分化，导致花芽不分化，或分化不完全，最终难以开花。因此虽说是反季节移栽，也要选择在植株开花前移栽，要选择花芽已完全分化且花蕾已形成时进行。
牡丹苗的选择 移栽时一定要选择植株健壮、无病虫害并且根系发达的牡丹种苗。除个别分枝能力差、根系欠发达的牡丹品种，如姚黄等少数品种外，大多数根系发达的品种均能进行移栽。
起苗时保证土球直径在40至50厘米即可，这样既可保证移栽后的成活率又可有效的节约运输成本。
包袋措施 为保证牡丹种苗能完整平安的运达施工现场，我们采用了稻草兜根护枝护苗的方法，保湿透气，避免根系干燥，有利于移栽后顺利成活。
定植
因北京土质一般为黏性土壤，所以，做好土壤的排水问题是保证牡丹成活及以后生长良好的关键。排水层做法为：在距土壤表层1至1.5米下开沟填埋粗石粒或陶粒作为排水层，厚度为40至50厘米。做好排水层后，即可在上面铺上以园土和腐殖土相混合的土壤。
运达现场后应尽快定植，如不能马上定植，应将牡丹种苗存放于阴凉通风处，并根据天气情况及时向叶面喷洒清水。定植时，先去掉稻草包装，并尽量保证牡丹土球的完整性。为保证当季种植的效果，可采用50厘米×60厘米的株行距进行定植。
定植后养护管理
修剪定植完成后，为保证牡丹移栽的成活率和当年着花量，应及时修剪。一是要将新生的土芽全部剪除，若打算用作更新整枝或矫正冠形的枝条则可以保留。二是要将过多花蕾疏除，每个枝条只可保留一个花蕾。
浇水 去蕾定植完成后，应立即浇足第一遍清水。因牡丹为肉质根系，第二次浇水可在2至3周后进行，在6月上旬浇完第三遍清水后即可停止浇水，但期间应不断进行叶面喷水。进入7至8月雨季后，还应充分注意排水问题。
遮阴降温 牡丹于4月上旬定植后，此时北京光照强度大，并且一进入5月份后，气温迅速回升。为减少叶片蒸腾量和延长牡丹花期，定植后进行遮阴降温是保障成活率的关键措施之一。可选用遮阴率为75%的遮阳网，搭于1米高的木架上，遮阴1个月左右。遮阴1个月后可见明显须根系长出，此时可去掉遮阳网。
病虫害防治 雨季过后，应主要防止霉病的发生。在8至9月份时，发病初期，用50%多菌灵可湿性颗粒800倍液交替使用，10天一次。
秋冬季管理 进入11月以后，在基部培土防寒，在11月底灌一次冻水。
第二年的管理 次年春季，最关键的管理时早春疏枝，即剪除弱枝，每株保留3至5个健壮枝条，去除所有萌糵芽，并摘除一部分花蕾，只保留1至3个，花后半个月追施一次磷钾肥。以后就可以正常管理。
